Леонид Михайлюк служит в ФСБ около 40 лет. С 1984 года он работал в органах безопасности на Дальнем Востоке и в Адыгее.
Несколько лет после этого возглавлял УФСБ России по Вологодской области, затем по Калининградской. В 2018 году его назначили начальником УФСБ России по Крыму и Севастополю. Имеет много государственных и ведомственных наград.