Он руководил воздушной гаванью в Новосибирске с 2012 года.
Евгений Янкилевич покинул пост генерального директора новосибирского аэропорта Толмачево и возглавил ООО «Новапорт Холдинг». С 24 августа врио гендиректора новосибирской гавани назначена Наталья Силаева, ранее занимавшая должность первого заместителя гендиректора.
Уход Евгения Янкилевича совпал с визитом в Новосибирск премьер-министра Михаила Мишустина. 24 июля председателю правительства РФ показывали реконструированный терминал Толмачёво.