В соответствии с новой нормативной базой из компетенции прокурора исключались полномочия по процессуальному руководству следствием и созданы реальные условия для последующей полной организационной и функциональной независимости следственного аппарата.
Председатель Следственного комитета при прокуратуре Российской Федерации являлся первым заместителем генерального прокурора, а работники Следственного комитета при прокуратуре Российской Федерации — прокурорскими работниками. Так было и на региональном уровне.