Может ли орфография влиять на произношение?

Казалось бы - нет.
Например, в Литературной энциклопедии сказано:
"ОРФОГРАФИЯ или правописание, - система общепринятых правил письма для какого-нибудь языка. Так, из возможных написаний «другова», «другово», «другого» правилам русской орфографии отвечает лишь последнее; следуя этим правилам, мы пишем «рожь», но «нож» (хотя в обоих случаях произносим на конце твердое «ш»), «садится», но «садиться» (хотя в обоих случаях произносим «сади`ца») и т. д."

Но в самом ли деле всё так просто?...