Древний Байкал, в отличие от многих других озер, имеет тектоническое происхождение. Он находится в котловине, окруженной со всех сторон сопками и горными хребтами. Дно этого глубокого водоема недостаточно хорошо изучено, поэтому специалисты выдвигают самые разнообразные версии о механизме появления подводных торнадо.
Например, исследователи обратили внимание, что на Байкале существуют как горизонтальные, так и вертикальные течения. То есть, его воды постоянно смешиваются, циркулируя не только по поверхности.