Трофимов в органах прокуратуры и Следственного комитета Российской Федерации по Оренбургской области находится с февраля 2006 года. С января 2016 года по август 2017 года замещал должность заместителя руководителя следственного отдела по Северному административному округу Оренбурга, а с 7 августа 2017 года майор юстиции стал руководителем следственного отдела по Южному административному округу.
Подразделение Сергея Трофимова занимается громкими и резонансными коррупционными делами.
Одним из таких дел стало мошенничество...